研究者業績
基本情報
- 所属
- 藤田医科大学 医学部 情報生命科学 准教授(兼任)精神・神経病態解明センター 計算科学部門 准教授
- 学位
- 博士(医学)(京都大学)
- 連絡先
- katsuyuki.kunida
fujita-hu.ac.jp - J-GLOBAL ID
- 201701001948114655
- researchmap会員ID
- B000284473
- 外部リンク
数理科学・数理工学の解析手法を基盤に、生物学・医学におけるさまざまな課題に取り組んでいます。細胞の移動、増殖、分化といった多様な機能を支える分子ネットワーク(タンパク質活性、遺伝子発現、代謝変動)の同定と制御を目指しています。さらに、データ数が限られる希少疾患を対象に、スモールデータ解析を活用した病態予測モデルの構築やリスク因子探索にも取り組んでいます。
主要な経歴
14-
2024年4月 - 現在
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2021年4月 - 2024年3月
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2017年9月 - 2021年3月
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2014年4月 - 2017年8月
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2012年10月 - 2014年3月
主要な委員歴
6-
2024年 - 現在
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2024年 - 現在
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2021年 - 現在
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2021年 - 現在
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2017年 - 現在
受賞
2論文
35-
Scientific Reports 15(1) 2025年7月2日 査読有り
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Scientific Reports 14(27252) 2024年11月 査読有り最終著者
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Pediatric Cardiology 2024年3月13日 査読有り
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New Generation Computing 42 283-302 2023年11月4日 査読有り最終著者責任著者
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Journal of Biomechanical Science and Engineering 18(4) 23-00336 2023年10月14日 査読有り最終著者
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Scientific Reports 13(1) 2023年9月 査読有り最終著者責任著者
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Proceedings of IFAC World Congress 2023 2023年7月 査読有り最終著者責任著者
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Cell Reports 42(2) 112071-112071 2023年2月 査読有り筆頭著者
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Proceedings of SICE Annual Conference 2021 2021年9月 査読有り最終著者責任著者
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Proceedings of SICE Annual Conference 2021 2021年9月 査読有り最終著者責任著者
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iScience 23(10) 101558-101558 2020年9月 査読有り
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Cell Reports 32(9) 108051-108051 2020年9月 査読有り
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Proceedings of IFAC World Congress 2020 2020年7月 査読有り最終著者責任著者
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Proceedings of IFAC World Congress 2020 2020年7月 査読有り筆頭著者責任著者
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Quantitative Biology 8 228-237 2020年6月 査読有り
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Proceedings of Asia-Pacific Signal and Information Processing Association Annual Summit and Conference (APSIPA ASC) 2019 731-735 2019年11月 査読有り最終著者
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Proceedings of SICE Annual Conference 2019 2019年9月 査読有り筆頭著者責任著者
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Proceedings of SICE Annual Conference 2018 1770-1771 2018年9月 査読有り筆頭著者
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Automatic Quantitative Segmentation of Myotubes Reveals Single-cell Dynamics of S6 Kinase ActivationCell Structure and Function 43(2) 153-169 2018年8月 査読有り
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Proceedings of Asian Control Conference (ASCC) 2017 2018- 1428-1431 2018年2月7日 査読有り
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PLOS Computational Biology 13(12) 2017年12月 査読有り
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Selective control of up-regulated and down-regulated genes by temporal patterns and doses of insulinScience Signaling 9(455) 112 2016年11月 査読有り
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Cell Reports 15(11) 2524-2535 2016年6月 査読有り
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Scientific Reports 4(5) 17527 2015年12月 査読有り
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Scientific Reports 1(5) 14589-14589 2015年8月 査読有り
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Cell Reports 8(4) 1171-1183 2014年8月 査読有り
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Journal of Cell Science 125(10) 2381-2392 2012年5月 査読有り筆頭著者
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Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 108(31) 12675-12680 2011年8月 査読有り
-
Molecular Cell 42(5) 650-661 2011年6月 査読有り
MISC
3-
medRxiv 2025年5月8日 責任著者Background: Fulminant myocarditis (FM) is a rare but life-threatening pediatric condition that rapidly progresses to cardiogenic shock and fatal arrhythmias. Early identification of prognostic biomarkers is vital for timely intervention and better outcomes. Although inflammatory cytokines contribute to FM pathogenesis, their prognostic value remains unclear. This study aimed to identify mortality-associated markers by integrating cytokine profiles and clinical variables through a machine learning approach.Methods: We retrospectively analyzed 21 pediatric FM cases from two tertiary centers (2012-2022). At admission, 37 cytokines and 14 clinical parameters were assessed. Partial least squares discriminant analysis was employed to identify prognostic features, with variable importance in projection scores quantifying their contribution. Model performance was evaluated using leave-one-out cross-validation. Statistical significance was determined via the Benjamini-Hochberg method at a false discovery rate of 0.05.Results: Of the 51 features analyzed, 23 emerged as key predictors with variable importance in projection scores above 1.0, including 20 cytokines and three clinical parameters. Six cytokines (TNFーα, M-CSF, MIP-1α, IL-8, IL-6, and IL-15) were both statistically significant and highly important. Elevated CK-MB and lactate levels and lower pH were also linked to poor outcomes. The model performed robustly, with an AUC of 0.92, 85.7% accuracy, 92.9% sensitivity, and 71.4% specificity.Conclusions: TNF-α emerged as a key cytokine linked to mortality in pediatric FM, supporting its role as a prognostic biomarker and potential therapeutic target.
主要な講演・口頭発表等
52-
第63回日本生物物理学会年会 2025年9月24日
主要な担当経験のある科目(授業)
12-
2025年 - 現在バイオダイナミクス (奈良先端大)
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2023年 - 現在
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2022年 - 現在アセンブリⅢ (藤田医大)
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2021年 - 現在基礎データサイエンス (藤田医大)
共同研究・競争的資金等の研究課題
6-
北海道大学遺伝子病制御研究所 一般共同研究 2024年4月 - 2025年3月
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文部科学省 科学研究費補助金 若手研究(生命、健康および医療情報学関連) 2019年4月 - 2023年3月
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NAIST 次世代融合領域研究推進プロジェクト 2019年6月 - 2021年3月
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JST 未来社会創造事業 特定課題調査 2019年11月 - 2020年3月
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文部科学省 科学研究費補助金 若手研究B(医化学一般) 2016年4月 - 2019年3月
主要な学術貢献活動
8メディア報道
7-
AAAS(American Association for the Advancement of Science) AAAS(American Association for the Advancement of Science) 2024年12月
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日本の研究.com 日本の研究.com 2024年11月 インターネットメディア
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AAAS(American Association for the Advancement of Science) EurekAlert! 2023年10月12日 インターネットメディア
-
Mary Ann Liebert, Inc. Genetic Engineering & Biotechnology News (GEN) 2023年10月 新聞・雑誌