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研究者業績

研究者リスト >> 柴田 直樹
 

柴田 直樹

 
アバター
研究者氏名柴田 直樹
 
シバタ ナオキ
URLhttp://www.sci.u-hyogo.ac.jp/life/biophys1/index-j.html
所属兵庫県立大学
部署大学院理学研究科生命科学専攻
職名助教授・准教授
学位博士(工学)(大阪大学)
J-Global ID200901039667162990

研究キーワード

 
結晶化 ,構造生物学 ,タンパク質 ,X線結晶構造解析 ,protein crystallization ,structural studies ,X-ray crystallography

研究分野

 
  • ライフサイエンス / 構造生物化学 / 

受賞

 
2003年12月
日本結晶学会, 平成15年度日本結晶学会賞進歩賞
柴田 直樹 
 

論文

 
 
Seiji Negoro   Naoki Shibata   Dai-Ichiro Kato   Yusuke Tanaka   Kengo Yasuhira   Keisuke Nagai   Shohei Oshima   Yoko Furuno   Risa Yokoyama   Kaito Miyazaki   Masahiro Takeo   Kowit Hengphasatporn   Yasuteru Shigeta   Young-Ho Lee   Yoshiki Higuchi   
The FEBS journal      2023年6月   [査読有り]
Nylon hydrolase (NylC), a member of the N-terminal nucleophile (Ntn) hydrolase superfamily, is responsible for the degradation of various aliphatic nylons, including nylon-6 and nylon-66. NylC is initially expressed as an inactive precursor (36 kD...
 
Naoki Shibata   Tetsuo Toraya   
Chembiochem : a European journal of chemical biology   e202300021   2023年3月   [査読有り][招待有り]
Adenosylcobalamin (AdoCbl) or coenzyme B12 is a naturally occurring organometallic compound that serves as a cofactor for enzymes that catalyze intramolecular group-transfer reactions and ribonucleotide reduction in a wide variety of organisms fro...
 
Naoki Shibata   Yoshiki Higuchi   Bernhard Kräutler   Tetsuo Toraya   
Chemistry (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)   28(65) e202202196   2022年11月   [査読有り]
The X-ray structures of coenzyme B12 (AdoCbl)-dependent eliminating isomerases complexed with adenosylmethylcobalamin (AdoMeCbl) have been determined. As judged from geometries, the Co-C bond in diol dehydratase (DD) is not activated even in the p...
 
Tetsuo Toraya   Takamasa Tobimatsu   Koichi Mori   Mamoru Yamanishi   Naoki Shibata   
Methods in enzymology   668 181-242   2022年   [査読有り][招待有り]
Adenosylcobalamin (AdoCbl) or coenzyme B12-dependent enzymes catalyze intramolecular group-transfer reactions and ribonucleotide reduction in a wide variety of organisms from bacteria to animals. They use a super-reactive primary-carbon radical fo...
 
Tetsuo Toraya   Takamasa Tobimatsu   Naoki Shibata   Koichi Mori   
Methods in enzymology   668 243-284   2022年   [査読有り][招待有り]
Adenosylcobalamin (AdoCbl) or coenzyme B12-dependent enzymes tend to undergo mechanism-based inactivation during catalysis or inactivation in the absence of substrate. Such inactivation may be inevitable because they use a highly reactive radical ...

MISC

 
 
柴田直樹   樋口芳樹   虎谷哲夫   
第468回ビタミンB研究協議会      2022年9月
 
根来誠司   武尾正弘   柴田直樹   樋口芳樹   加藤太一郎   重田育照   
月刊バイオインダストリー      2019年6月   [招待有り]
 
Yamanaka Masaru   Hoshizumi Makoto   Nagao Satoshi   Nakayama Ryoko   Shibata Naoki   Higuchi Yoshiki   Hirota Shun   
   2017年2月
The number of artificial protein supramolecules has been increasing; however, control of protein oligomer formation remains challenging. Cytochrome c′ from Allochromatium vinosum (AVCP) is a homodimeric protein in its native form, where its protom...
 
衣笠 凌   羽田 圭吾   谷本 悠樹   竹原 一起   柴田 直樹   加藤 太一郎   武尾 正弘   根来 誠司   
日本生物工学会大会講演要旨集   67 282-282   2015年
 
Y. Higuchi   M. Akter   C. Inoue   Y. Shomura   N. Shibata   K. Inaka   K. Kataoka   T. Sakurai   K. Komori   
JOURNAL OF BIOLOGICAL INORGANIC CHEMISTRY   19 S324-S324   2014年3月   

書籍等出版物

 
 
加藤太一郎, 柴田直樹, 根来誠司(担当:共著, 範囲:10節 ナイロン加水分解酵素群(Nyl series)の遺伝子・酵素学的研究の進展と効率的な酵素的モノマー化への展開)
株式会社技術情報協会   2023年10月   (ISBN:9784867980101)
 
根来誠司, 武尾正弘, 柴田直樹, 樋口芳樹, 加藤太一郎, 重田育照(担当:共著, 範囲:pp. 195–207)
シーエムシー出版   2019年7月   
 
柴田 直樹(担当:分担執筆, 範囲:ビタミンB12 関与ラジカル酵素)
日本結晶学会   2014年      

所属学協会

 
 
   
 
日本蛋白質科学会
 
   
 
日本放射光学会
 
   
 
日本生化学会
 
   
 
日本生物物理学会
 
   
 
日本結晶学会

共同研究・競争的資金等の研究課題

 
 
Wntシグナル因子が関わる新規癌細胞増殖シグナル活性化と阻害抗体の構造基盤
日本学術振興会: 科学研究費助成事業 基盤研究(B)
柴田 直樹 
研究期間: 2021年4月 - 2024年3月