久保稔

研究者氏名	久保稔
	クボミノル
URL
所属	兵庫県立大学
部署	大学院理学研究科
職名	教授
学位	博士（理学）(北海道大学)
その他の所属	理化学研究所客員研究員
科研費研究者番号	90392878
J-Global ID	200901071216606810

研究キーワード

生体系の時間分解計測 ,動的構造生物学 ,振動分光学 ,Dynamic structural biology ,Vibrational spectroscopy ,Time-resolved analysis of biomolecular systems

研究分野

ライフサイエンス / 生物物理学 /
ライフサイエンス / 構造生物化学 /
ナノテク・材料 / 生体化学 /

経歴

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2021年4月

現在

兵庫県立大学大学院理学研究科教授

2018年7月

2021年3月

兵庫県立大学大学院生命理学研究科教授

2014年4月

2018年6月

理化学研究所放射光科学総合研究センター専任研究員

2012年10月

2016年3月

JST さきがけ研究員（兼任）

2012年10月

2014年3月

理化学研究所放射光科学総合研究センター研究員

学歴

2000年4月

2003年3月

北海道大学大学院理学研究科生物科学専攻

1998年4月

2000年3月

早稲田大学大学院理工学研究科物理学及応用物理学専攻

1994年4月

1998年3月

早稲田大学理工学部応用物理学科

委員歴

2023年6月

現在

日本生物物理学会代議員

2022年1月

現在

日本生物物理学会ウェブサイト編集委員

2019年6月

2021年6月

日本生物物理学会代議員

2020年1月

2020年12月

日本生物物理学会分野別専門委員（放射光）

2017年1月

2017年12月

日本生物物理学会分野別専門委員（赤外・ラマン）

受賞

2023年7月

令和５年度兵庫県立大学研究活動教員表彰優秀研究活動賞

2016年10月

第42回内藤コンファレンスポスター賞（第45回内藤記念特定研究助成金贈呈）

2011年12月

平成23年度日本分光学会年次講演会若手講演賞

論文

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A three-dimensional movie of structural changes in bacteriorhodopsin

Eriko Nango Antoine Royant Minoru Kubo Takanori Nakane Cecilia Wickstrand Tetsunari Kimura Tomoyuki Tanaka Kensuke Tono Changyong Song Rie Tanaka Toshi Arima Ayumi Yamashita Jun Kobayashi Toshiaki Hosaka Eiichi Mizohata Przemyslaw Nogly Michihiro Sugahara Daewoong Nam Takashi Nomura Tatsuro Shimamura Dohyun Im Takaaki Fujiwara Yasuaki Yamanaka Byeonghyun Jeon Tomohiro Nishizawa Kazumasa Oda Masahiro Fukuda Rebecka Andersson Petra Bath Robert Dods Jan Davidsson Shigeru Matsuoka Satoshi Kawatake Michio Murata Osamu Nureki Shigeki Owada Takashi Kameshima Takaki Hatsui Yasumasa Joti Gebhard Schertler Makina Yabashi Ana-Nicoleta Bondar Jorg Standfuss Richard Neutze So Iwata

SCIENCE 354(6319) 1552-1557 2016年12月 [査読有り]

Bacteriorhodopsin (bR) is a light-driven proton pump and a model membrane transport protein. We used time-resolved serial femtosecond crystallography at an x-ray free electron laser to visualize conformational changes in bR from nanoseconds to mil...

A Study of the Dynamics of the Heme Pocket and C-helix in CooA upon CO Dissociation Using Time-Resolved Visible and UV Resonance Raman Spectroscopy

Akihiro Otomo Haruto Ishikawa Misao Mizuno Tetsunari Kimura Minoru Kubo Yoshitsugu Shiro Shigetoshi Aono Yasuhisa Mizutani

JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY B 120(32) 7836-7843 2016年8月 [査読有り]

CooA is a CO-sensing transcriptional activator from the photosynthetic bacterium Rhodospirillum rubrum that binds CO at the heme iron. The heme iron in ferrous CooA has two axial ligands: His77 and Pro2. CO displaces Pro2 and induces a conformatio...

Lipidic cubic phase injector is a viable crystal delivery system for time-resolved serial crystallography

Przemyslaw Nogly Valerie Panneels Garrett Nelson Cornelius Gati Tetsunari Kimura Christopher Milne Despina Milathianaki Minoru Kubo Wenting Wu Chelsie Conrad Jesse Coe Richard Bean Yun Zhao Petra Bath Robert Dods Rajiv Harimoorthy Kenneth R. Beyerlein Jan Rheinberger Daniel James Daniel DePonte Chufeng Li Leonardo Sala Garth J. Williams Mark S. Hunter Jason E. Koglin Peter Berntsen Eriko Nango So Iwata Henry N. Chapman Petra Fromme Matthias Frank Rafael Abela Sebastien Boutet Anton Barty Thomas A. White Uwe Weierstall John Spence Richard Neutze Gebhard Schertler Jorg Standfuss

NATURE COMMUNICATIONS 7 12314 2016年8月 [査読有り]

Serial femtosecond crystallography (SFX) using X-ray free-electron laser sources is an emerging method with considerable potential for time-resolved pump-probe experiments. Here we present a lipidic cubic phase SFX structure of the light-driven pr...

A nearly on-axis spectroscopic system for simultaneously measuring UV-visible absorption and X-ray diffraction in the SPring-8 structural genomics beamline

Miyuki Sakaguchi Tetsunari Kimura Takuma Nishida Takehiko Tosha Hiroshi Sugimoto Yoshihiro Yamaguchi Sachiko Yanagisawa Go Ueno Hironori Murakami Hideo Ago Masaki Yamamoto Takashi Ogura Yoshitsugu Shiro Minoru Kubo

JOURNAL OF SYNCHROTRON RADIATION 23 334-338 2016年1月 [査読有り]

UV-visible absorption spectroscopy is useful for probing the electronic and structural changes of protein active sites, and thus the on-line combination of X-ray diffraction and spectroscopic analysis is increasingly being applied. Herein, a novel...

Effective Pumping Proton Collection Facilitated by a Copper Site (CUB) of Bovine Heart Cytochrome c Oxidase, Revealed by a Newly Developed Time-resolved Infrared System

Minoru Kubo Satoru Nakashima Satoru Yamaguchi Takashi Ogura Masao Mochizuki Jiyoung Kang Masaru Tateno Kyoko Shinzawa-Itoh Koji Kato Shinya Yoshikawa

JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY 288(42) 30259-30269 2013年10月 [査読有り]

Background: Cytochrome c oxidase reduces O-2 coupled with proton pumping. Results: A newly developed time-resolved infrared system reveals transient conformational changes in the proton-pumping pathway upon CO binding to Cu-B in the O-2 reduction ...

MISC

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SACLA時分割結晶構造解析による動的構造生物学研究～酵素反応の可視化に向けた分子動画～

久保稔

放射光 33 266-270 2020年7月 [査読有り]

Pump-Probe Time-Resolved Serial Femtosecond Crystallography at SACLA: Current Status and Data Collection Strategies

Eriko Nango Minoru Kubo Kensuke Tono So Iwata

Applied Sciences 9(24) 5505-5505 2019年12月 [査読有り]

Structural information on protein dynamics is a critical factor in fully understanding the protein functions. Pump-probe time-resolved serial femtosecond crystallography (TR-SFX) is a recently established technique for visualizing the structural c...

SACLAを利用した酵素反応の可視化

當舎武彦久保稔

生物物理 59(4) 205-207 2019年 [査読有り]

X線自由電子レーザーによる蛋白質の時分割・無損傷結晶構造解析

久保稔

光学 47 431-434 2018年 [招待有り]

XFEL時分割構造解析法を用いたチトクロム酸化酵素のプロトンポンプ経路開閉機構の解明

島田敦広久保稔馬場清喜

放射光 31 226‐237 2018年 [招待有り]