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研究者業績

研究者リスト >> 柴田 直樹
 

柴田 直樹

 
アバター
研究者氏名柴田 直樹
 
シバタ ナオキ
URLhttp://www.sci.u-hyogo.ac.jp/life/biophys1/index-j.html
所属兵庫県立大学
部署大学院理学研究科生命科学専攻
職名助教授・准教授
学位博士(工学)(大阪大学)
J-Global ID200901039667162990

研究キーワード

 
結晶化 ,構造生物学 ,タンパク質 ,X線結晶構造解析 ,protein crystallization ,structural studies ,X-ray crystallography

研究分野

 
  • ライフサイエンス / 構造生物化学 / 

受賞

 
2003年12月
日本結晶学会, 平成15年度日本結晶学会賞進歩賞
柴田 直樹 
 

論文

 
 
Satoshi Nagao   Ayaka Idomoto   Naoki Shibata   Yoshiki Higuchi   Shun Hirota   
Journal of inorganic biochemistry   217 111374-111374   2021年4月   [査読有り]
The metal active site is precisely designed in metalloproteins. Here we applied 3D domain swapping, a phenomenon in which a partial protein structure is exchanged between molecules, to introduce metal sites in proteins. We designed multiple metal-...
 
Cheng Xie   Hiromitsu Shimoyama   Masaru Yamanaka   Satoshi Nagao   Hirofumi Komori   Naoki Shibata   Yoshiki Higuchi   Yasuteru Shigeta   Shun Hirota   
RSC Advances   11(59) 37604-37611   2021年   [査読有り]
The tight H-bond network enhanced the helices at the hinge region and stabilized the myoglobin dimer, providing a unique example of using H-bonds in the design of a dimeric protein through 3D domain swapping.
 
Seiji Negoro   Dai-Ichiro Kato   Taku Ohki   Kengo Yasuhira   Yasuyuki Kawashima   Keisuke Nagai   Masahiro Takeo   Naoki Shibata   Katsumasa Kamiya   Yasuteru Shigeta   
Methods in enzymology   648 357-389   2021年   [査読有り][招待有り]
Biodegradation of synthetic polymers is recognized as a useful way to reduce their environmental load and pollution, loss of natural resources, extensive energy consumption, and generation of greenhouse gases. The potential use of enzymes responsi...
 
Satoshi Nagao   Ayaka Suda   Hisashi Kobayashi   Naoki Shibata   Yoshiki Higuchi   Shun Hirota   
Chemistry, an Asian journal   15(11) 1743-1749   2020年6月   [査読有り]
Domain swapping is an exception to Anfinsen's dogma, and more than one structure can be produced from the same amino acid sequence by domain swapping. We have previously shown that myoglobin (Mb) can form a domain-swapped dimer in which the hinge ...
 
Robby Noor Cahyono   Masaru Yamanaka   Satoshi Nagao   Naoki Shibata   Yoshiki Higuchi   Shun Hirota   
Metallomics : integrated biometal science   12(3) 337-345   2020年3月   [査読有り]
Protein oligomers have gained interest, owing to their increased knowledge in cells and promising utilization for future materials. Various proteins have been shown to 3D domain swap, but there has been no domain swapping report on a blue copper p...

MISC

 
 
柴田直樹   樋口芳樹   虎谷哲夫   
第468回ビタミンB研究協議会      2022年9月
 
根来誠司   武尾正弘   柴田直樹   樋口芳樹   加藤太一郎   重田育照   
月刊バイオインダストリー      2019年6月   [招待有り]
 
Yamanaka Masaru   Hoshizumi Makoto   Nagao Satoshi   Nakayama Ryoko   Shibata Naoki   Higuchi Yoshiki   Hirota Shun   
   2017年2月
The number of artificial protein supramolecules has been increasing; however, control of protein oligomer formation remains challenging. Cytochrome c′ from Allochromatium vinosum (AVCP) is a homodimeric protein in its native form, where its protom...
 
衣笠 凌   羽田 圭吾   谷本 悠樹   竹原 一起   柴田 直樹   加藤 太一郎   武尾 正弘   根来 誠司   
日本生物工学会大会講演要旨集   67 282-282   2015年
 
Y. Higuchi   M. Akter   C. Inoue   Y. Shomura   N. Shibata   K. Inaka   K. Kataoka   T. Sakurai   K. Komori   
JOURNAL OF BIOLOGICAL INORGANIC CHEMISTRY   19 S324-S324   2014年3月   

書籍等出版物

 
 
柴田 直樹(担当:分担執筆, 範囲:ビタミンB12 関与ラジカル酵素)
日本結晶学会   2014年      

所属学協会

 
 
   
 
日本蛋白質科学会
 
   
 
日本放射光学会
 
   
 
日本生化学会
 
   
 
日本生物物理学会
 
   
 
日本結晶学会

共同研究・競争的資金等の研究課題

 
 
Wntシグナル因子が関わる新規癌細胞増殖シグナル活性化と阻害抗体の構造基盤
日本学術振興会: 科学研究費助成事業 基盤研究(B)
柴田 直樹 
研究期間: 2021年4月 - 2024年3月
 
がん細胞増殖シグナルを活性化するタンパク質複合体の構造生物学
公益財団法人 ひょうご科学技術協会: 平成31年度学術研究助成
研究期間: 2019年4月 - 2020年3月
 
研究期間: 2018年10月 - 2019年9月
 
ナイロン加水分解酵素の分子設計と産業応用への基盤研究
日本学術振興会: 科学研究費助成事業 基盤研究(B)
根来 誠司 武尾 正弘 加藤 太一郎 樋口 芳樹 柴田 直樹 重田 育照 後藤 祐児 永井 圭介 竹原 一起 
研究期間: 2014年4月 - 2019年3月
 
二重特異性を有する分子認識機能性分子を利用した新規結晶化法の開発
日本学術振興会: 科学研究費助成事業 挑戦的萌芽研究
柴田 直樹 
研究期間: 2014年4月 - 2017年3月